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研究開発資源 · TOPIC v1

Detectronで、どのファージがどの菌株で活動したかを読む

どの細胞で、どのRNAが現れたかを、後からどこまで読めるか。

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2026-11-04 16:54:52.561 UTC · 最終記録

現在地

大腸菌でファージ3種を識別し、別の実験ではT7に対する宿主6株の応答を比較した。

出典を踏まえた編集上の状態分類。成熟度スコアではありません。

  1. 細菌で検出・比較確認済み
  2. 哺乳類で検証未確認
新しい問いを起票 · v1

細菌で実証した測定と、哺乳類での応用仮説を区別して記録。

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01 / 追っている問い

どの細胞で、どのRNAが現れたかを、後からどこまで読めるか。

02 / 現在の根拠・技術

RNAセンサー・レトロン・DNAバーコード

03 / 編集の読み解き

既知の菌株を並列に調べられる。哺乳類細胞では、感染歴と宿主応答を分けて記録し、回復の違いを追う用途が考えられる。

04 / まだ言えないこと

一般化できる検出限界や判定時間、哺乳類細胞でのDetectronの動作は未確立。

05 / 次に確認すること

低頻度の感染、近縁配列への交差反応、単一細胞での記録の回収と保持を評価する。

仮説を、検証できる形で残す

検証中の仮説

感染と免疫応答を別々のタグに記録すれば、感染後の気道上皮で回復する細胞を追跡できる。

見直す条件: 記録が消失するか、センサー自体が免疫応答を変える場合、回復の解釈に使えない。

今後の検証案であり、予測の的中率ではありません。カード間のリンク自体も仮説の検証にはなりません。

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  1. v1 · 2026-11-04 16:54:52.561 UTC新しい問いを起票

    細菌で実証した測定と、哺乳類での応用仮説を区別して記録。

    当時の判断:大腸菌でファージ3種を識別し、別の実験ではT7に対する宿主6株の応答を比較した。

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背景を読み解く記事

出典の日付・確認範囲

Gladstone’s explanation ↗
Gladstone Institutes · 2026-10-05 · research-institution-commentary

Retrons in human cells ↗
Nature Biotechnology · 2024-09-17 · peer-reviewed-study

Existing E. coli resistance screen ↗
PLOS Biology · 2020 · peer-reviewed-study

Original study of respiratory syncytial virus in airway epithelium ↗
Science Advances · 2026-06-19 · peer-reviewed-study

Example of bacterial defense that blocks phage assembly ↗
Nature Communications · 2024 · peer-reviewed-study

RNA sensing in mammalian cells ↗
Nature · 2022-10-05 · peer-reviewed-study

Recordanelle original study ↗
Nature Biotechnology · 2026-10-21 · peer-reviewed-study

Original study in Nature Biotechnology ↗
Nature Biotechnology · 2026-10-05 · peer-reviewed-study

Experiment distinguishing three phages ↗
Nature Biotechnology · 2026-10-05 · peer-reviewed-study

Strain-by-strain comparison in mixed culture ↗
Nature Biotechnology · 2026-10-05 · peer-reviewed-study

Original study, Extended Data Figures 7 and 8 ↗
Nature Biotechnology · 2026-10-05 · peer-reviewed-study

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